盤點近期最熱的基因組測序新成果

　　種屬：蘭花(Phalaenopsis equestris)

　　基因組：約1.2billionbp

　　我國研究團隊于十一月二十四日在Nature Genetics雜志上發(fā)布了小蘭嶼蝴蝶蘭(Phalaenopsis equestris)的基因組序列。這是一種廣泛用于雜交育種的蘭花品種，基因組含有29，431個蛋白編碼基因。這一成果為進一步的蘭花生物學研究奠定了基礎。

　　該項目由清華大學深圳研究生院黃來強教授和國家蘭科植物種質資源保護中心暨深圳市蘭科植物保護研究中心劉仲健教授領銜完成，參與單位還包括臺灣成功大學、中國科學院植物所、比利時根特大學、深圳華大基因研究院、華南農業(yè)大學林學院等多個研究團隊。

　　種屬：川金絲猴(Rhinopithecus roxellana)

　　基因組：約3billionbp

　　中科院動物研究所、中國科學院大學、北京諾禾致源(Novogene)公司的研究團隊測序和裝配了一只雄性川金絲猴的基因組，并將其與三個近緣物種進行了比較。這一成果發(fā)表在十一月二日的NatureGenetics雜志上。研究人員發(fā)現，川金絲猴從脂肪酸獲取能量和降解外源物質的能力得到了增強。這些信息可以幫助人們進一步理解疣猴亞科的膳食適應和進化史。

　　種屬：腸病毒D68(EV-D68)

　　過去幾個月，腸病毒D68令數百名美國兒童患病。華盛頓大學的研究人員測序和分析了腸病毒D68(EV-D68)的基因組，這一成果將發(fā)表在新一期的 Emerging Infectious Diseases雜志上。(Genome Sequence of Enterovirus D68 from St. Louis，Missouri，USA)

　　腸病毒D68(EV-D68)能在兒童中引起嚴重的呼吸道疾病。其基因組序列可以“幫助人們開發(fā)更好的診斷測試，”共同作者GregoryStorch說�！坝兄�于解釋病毒感染為什么會造成嚴重的疾病，以及EV-D68為什么比過去傳播得更廣�！�

　　種屬：蜈蚣(Strigamia maritima)

　　基因組：290millionbp

　　包括Baylor醫(yī)學院在內的國際團隊首次完成了多足類動物的基因組測序，一種生活在海邊的蜈蚣Strigamia maritima。這一成果發(fā)表在十一月二十五日的PLOS Biology雜志上。

　　S.maritima有毒而且生活在地下。研究人員認為，這種蜈蚣的基因組序列有助于日后研究多足類動物的進化。

　　“它的一些基因可以為人們提供直接的幫助。蜈蚣能通過注射毒液使獵物麻痹，”文章的共同作者，劍橋大學的Michael Akam說�！斑@種毒液的成分往往可以制成強力的藥物，蜈蚣基因組序列將幫助人們找到編碼這些成分的基因�！�

　　種屬：彈涂魚(Boleophthalmus pectinirostris、Scartelaos histophorus、Periophthalmodon schlosseri、P. magnuspinnatus)

　　基因組：平均827millionbp

　　彈涂魚又稱跳跳魚，是世界上唯一一種能在陸地上活動的魚類。它們適應獨特的生境，生活在近海沿岸及河口高潮區(qū)以下的灘涂上或是咸淡水的交界處。彈涂魚既能在水中呼吸，也能在空氣中呼吸。

　　深圳華大基因研究院的科學家們對來自不同棲息地的四種彈涂魚進行了基因組測序，這項研究發(fā)表在十二月二日的Nature Communications雜志上。研究顯示，彈涂魚的魚鰓中有關氨排泄的幾個基因經歷了正向選擇，“表明它們對于彈涂魚耐受環(huán)境氨的能力很重要”。此外，研究人員還對彈涂魚的視覺相關基因進行了研究。

　　脊椎動物從水生向陸生過渡是一個重要的進化事件，而彈涂魚基因組為此提供了寶貴的信息。